注冊會計師簽發的審計報告，主要具有鑒證、保護和證明三方面的作用。
(一)鑒證作用
注冊會計師簽發的審計報告，不同于政府審計和內部審計的審計報告，是以超然獨立的第三者身份，對被審計單位財務報表合法性、公允性發表意見。這種意見，具有鑒證作用，得到了政府及其各部門和社會各界的普遍認可。政府有關部門，如財政部門、稅務部門等了解、掌握企業的財務狀況和經營成果的主要依據是企業提供的財務報表。財務報表是否合法、公允，主要依據注冊會計師的審計報告做出判斷。股份制企業的股東主要依據注冊會計師的審計報告來判斷被投資企業的財務報表是否公允地反映了財務狀況和經營成果，以進行投資決策等。
(二)保護作用
注冊會計師通過審計，可以對被審計單位財務報表出具不同類型審計意見的審計報告，以提高或降低財務報表信息使用者對財務報表的信賴程度，能夠在一定程度上對被審計單位的財產、債權人和股東的權益及企業利害關系人的利益起到保護作用。如投資者為了減少投資風險，在進行投資之前，必須要查閱被投資企業的財務報表和注冊會計師的審計報告，了解被投資企業的經營情況和財務狀況。投資者根據注冊會計師的審計報告做出投資決策，可以降低其投資風險。
(三)證明作用
審計報告是對注冊會計師審計任務完成情況及其結果所做的總結，它可以表明審計工作的質量并明確注冊會計師的審計責任。因此，審計報告可以對審計工作質量和注冊會計師的審計責任起證明作用。通過審計報告，可以證明注冊會計師在審計過程中是否實施了必要的審計程序，是否以審計工作底稿為依據發表審計意見，發表的審計意見是否與被審計單位的實際情況相一致，審計工作的質量是否符合要求。通過審計報告，可以證明注冊會計師審計責任的履行情況。
